女子出轨导致丈夫发现孩子非亲生的情况，可以通过以下几种方式来查证：

1. 亲子鉴定：专业的鉴定机构运用特定的基因检测技术，对比孩子与疑似父亲的DNA序列，若存在高度吻合的基因位点，即可认定亲子关系。可以选择个人隐私亲子鉴定，自己采集样本送检，这种方式比较隐秘，能保护个人隐私。例如偷偷收集孩子和自己的毛发、口腔拭子等样本，送到专业的鉴定机构。

2. 收集其他证据：若丈夫怀疑孩子非亲生，可尝试收集其他证据，如聊天记录、照片、视频等，证明妻子出轨的事实。聊天记录要注意保存原始载体，照片和视频要清晰能反映出轨事实。此外，若出生证明上记载丈夫是婚外所生子女的生父，也可作为直接的书面证据。根据司法实践，私生子的出生证明、手机短信、电话录音、QQ聊天记录以及证人证言都可以作为丈夫婚外生子的证据。

3. 法律途径：若丈夫怀疑孩子非亲生并向法院提起亲子关系否认之诉，且提供必要证据（如孩子出生日期与婚姻存续时间矛盾等），法院可依申请委托有资质机构做DNA鉴定，以确定生物学父亲。

需要注意的是，面对此类情况，应避免伪造孩子出生证明等文件，这属于违法行为，一旦被发现，不仅无法解决问题，还可能面临法律制裁。同时，对丈夫怀疑采取激烈对抗的方式，可能会让丈夫更坚定怀疑，促使其采取更多调查手段。此外，盲目相信能完全隐瞒也是不可取的，因为科技发展与信息渠道增多使隐瞒难度极大。